提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
澳门除夕日录得入境旅客逾2.8万人次 为国庆日后单日最高******
中新社澳门1月1日电 (记者 李亚南)澳门特区政府旅游局2023年1月1日发布消息称,澳门的入境旅客人次继续稳步上升。数据显示,2022年12月31日除夕日录得入境旅客28100人次,是自10月1日国庆日后录得的单日最高入境旅客人次。
旅游局发布的数据显示,澳门2022年12月30日录得逾1.8万人次入境旅客,对比12月临时数据日均旅客约1.2万人次有明显升幅,反映旅客游澳门信心提升,预计新年及春节假期旅客将稳步上扬。
据介绍,旅游局已部署多项吸引旅客来澳门旅游的计划。旅游局日前率先为港澳两地业界举办虚拟旅游暨交流会,向香港业界更新澳门旅游资讯,促进港澳业界交流对接。旅游局已计划与业界合作推出旅游优惠,包含车票或船票以及食、住、游等优惠,吸引香港旅客来澳门体验独特的中葡文化及美食等;还计划组织香港旅游业界考察团来澳,促进业界合作商机。
随着澳门优化入境防疫措施,入境澳门限制进一步放宽,旅游局计划2023年将开展内地和海外全方位宣传工作,以及陆续铺开盛事活动,提升旅客游澳门意欲,带动澳门各行各业复苏。(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎)